Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Lrrc8bQ5DU41 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Lrrc8bQ5DU41 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms