Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rtl5Q5DTT4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rtl5Q5DTT4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms