Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Lrig2Q52KR2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Lrig2Q52KR2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.8 ms