Protein–RNA interactions for Protein: Q497M0

Samt2, Predicted gene, EG434881, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt2Q497M0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Samt2Q497M0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samt2Q497M0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms