Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
6430531B16RikQ3V2J1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
6430531B16RikQ3V2J1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.6 ms