Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScimpQ3UU41 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ScimpQ3UU41 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms