Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Prrc1Q3UPH1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prrc1Q3UPH1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms