Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Skap2Q3UND0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Skap2Q3UND0 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms