Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tmem253Q3UNB8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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Tmem253Q3UNB8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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Tmem253Q3UNB8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem253Q3UNB8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Tmem253Q3UNB8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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