Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Hdgfl2Q3UMU9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hdgfl2Q3UMU9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms