Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3aQ3UFY4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3aQ3UFY4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms