Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Garem1Q3UFT3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Garem1Q3UFT3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms