Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fam35aQ3UEN2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fam35aQ3UEN2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms