Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Yipf3Q3UDR8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Yipf3Q3UDR8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms