Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Parp8Q3UD82 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Parp8Q3UD82 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms