Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trip13Q3UA06 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trip13Q3UA06 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms