Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf166Q3U9F6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf166Q3U9F6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf166Q3U9F6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rnf166Q3U9F6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Rnf166Q3U9F6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rnf166Q3U9F6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms