Protein–RNA interactions for Protein: Q3U7U4

Transmembrane protein C1orf162 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U7U4 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U7U4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q3U7U4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U7U4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q3U7U4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U7U4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U7U4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U7U4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U7U4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Q3U7U4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms