Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Fam193bQ3U2K0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Fam193bQ3U2K0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms