Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vars2Q3U2A8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vars2Q3U2A8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Vars2Q3U2A8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms