Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Palb2Q3U0P1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Palb2Q3U0P1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms