Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Hace1Q3U0D9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Hace1Q3U0D9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms