Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gtf3c3Q3TMP1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gtf3c3Q3TMP1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms