Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pdlim7Q3TJD7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Pdlim7Q3TJD7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms