Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RubcnlQ3TD16 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RubcnlQ3TD16 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RubcnlQ3TD16 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms