Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hddc2Q3SXD3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hddc2Q3SXD3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms