Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccbe1Q3MI99 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccbe1Q3MI99 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms