Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam178bQ24JP3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam178bQ24JP3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms