Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Ptcd3Q14C51 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ptcd3Q14C51 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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