Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
VgfQ0VGU4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
VgfQ0VGU4 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
VgfQ0VGU4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms