Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rundc1Q0VDN7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rundc1Q0VDN7 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms