Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Vps8Q0P5W1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Vps8Q0P5W1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps8Q0P5W1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms