Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TrioQ0KL02 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TrioQ0KL02 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms