Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Cnnm1Q0GA42 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cnnm1Q0GA42 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms