Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slc7a1Q09143 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slc7a1Q09143 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc7a1Q09143 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc7a1Q09143 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc7a1Q09143 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc7a1Q09143 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc7a1Q09143 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slc7a1Q09143 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms