Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tgm3Q08189 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tgm3Q08189 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms