Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ebf1Q07802 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ebf1Q07802 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms