Protein–RNA interactions for Protein: Q07279

Nfe2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2Q07279 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nfe2Q07279 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nfe2Q07279 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms