Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Atf4Q06507 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atf4Q06507 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms