Protein–RNA interactions for Protein: Q04899

Cdk18, Cyclin-dependent kinase 18, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk18Q04899 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdk18Q04899 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Cdk18Q04899 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms