Protein–RNA interactions for Protein: Q04891

Sox13, Transcription factor SOX-13, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox13Q04891 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Sox13Q04891 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Sox13Q04891 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Sox13Q04891 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms