Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Emx2Q04744 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Emx2Q04744 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms