Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cxcr5Q04683 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cxcr5Q04683 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms