Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Smpd1Q04519 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Smpd1Q04519 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms