Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Thbs2Q03350 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Thbs2Q03350 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms