Protein–RNA interactions for Protein: Q02983

RRN5, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN5, yeastyeast

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN5Q02983 VPS64YDR200C 1815 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 NEW1YPL226W 3591 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YER119C-AYER119C-A 372 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 SEC4YFL005W 648 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 IRC21YMR073C 606 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 ESF2YNR054C 951 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 CAT5YOR125C 702 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 HUA2YOR284W 732 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 SVL3YPL032C 2478 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YPK1YKL126W 2043 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 SRB4YER022W 2064 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 TOR1YJR066W 7413 nt2.35□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 MAL33YBR297W 1407 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YJL114WYJL114W 681 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 MBB1YJL199C 327 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YKR070WYKR070W 1059 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YOL107WYOL107W 1029 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 YPL135C-AYPL135C-A 174 nt2.34□□□□□ -2.03
RRN5Q02983 MLH1YMR167W 2310 nt2.34□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 KAR5YMR065W 1515 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 INP53YOR109W 3324 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 CCE1YKL011C 1062 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YOL166CYOL166C 339 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YOR050CYOR050C 348 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RPS12YOR369C 432 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YBR209WYBR209W 318 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 DAD3YBR233W-A 285 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 ASI3YNL008C 2031 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 CBF2YGR140W 2871 nt2.33□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 UTP15YMR093W 1542 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 FKS3YMR306W 5358 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 UBC13YDR092W 462 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YDR203WYDR203W 318 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 GPI19YDR437W 423 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 SDC1YDR469W 528 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 HOT13YKL084W 351 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 SAS2YMR127C 1017 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YNL089CYNL089C 477 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YOL019W-AYOL019W-A 153 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RPB8YOR224C 441 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YOR331CYOR331C 558 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 MBA1YBR185C 837 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YDR179W-AYDR179W-A 1392 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 AEP1YMR064W 1557 nt2.32□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YEL043WYEL043W 2871 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 COG3YER157W 2406 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 BNI1YNL271C 5862 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 FUS2YMR232W 2034 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YGL117WYGL117W 798 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 PEX18YHR160C 852 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YKL069WYKL069W 543 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RPS17AYML024W 411 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 KTI11YBL071W-A 249 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 IRC14YOR135C 342 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YPL276WYPL276W 438 nt2.31□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 DPP1YDR284C 870 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YER189WYER189W 369 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 ACB1YGR037C 264 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 GPI14YJR013W 1212 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 GAB1YLR459W 1185 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 BTS1YPL069C 1008 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RPC40YPR110C 1008 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RSM23YGL129C 1353 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 BI3Q0115 1554 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 STE11YLR362W 2154 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RGA1YOR127W 3024 nt2.3□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 SPT15YER148W 723 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YFL015CYFL015C 495 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 COG7YGL005C 840 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 MVB12YGR206W 306 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 FMP41YNL168C 780 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YOL118CYOL118C 309 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 HEM4YOR278W 828 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RSA1YPL193W 1146 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 JID1YPR061C 906 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 NTC20YBR188C 423 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YRR1YOR162C 2433 nt2.29□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 SNU114YKL173W 3027 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 SCD5YOR329C 2619 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 UBX3YDL091C 1368 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YJL049WYJL049W 1353 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 RAV1YJR033C 4074 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.28□□□□□ -2.04
RRN5Q02983 ATG10YLL042C 504 nt2.28□□□□□ -2.04
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