Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Htr1fQ02284 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Htr1fQ02284 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms