Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl1Q02067 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms