Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Uba1Q02053 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Uba1Q02053 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms