Protein–RNA interactions for Protein: Q01965

Ly9, T-lymphocyte surface antigen Ly-9, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly9Q01965 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ly9Q01965 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ly9Q01965 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms